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使用GMMX模塊對分子
進(jìn)行構(gòu)象搜索

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Amelie Mayer

使用GMMX模塊對分子
進(jìn)行構(gòu)象搜索

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軟件版本

  • 最新版本:GMMX3.1

支持的操作系統(tǒng)

? x86-64 Linux
? IA32 Linux
? 64-bit MacOSX
? 32-bit Windows
? 64-bit Windows

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為什么需要GMMX?

您可能遇到過各種各樣的分子構(gòu)象相關(guān)問題,現(xiàn)在您可以在GaussView 6中使用新增的GMMX模塊進(jìn)行構(gòu)象搜索。

? GMMX-構(gòu)象搜索模塊安裝[點(diǎn)擊查看
? GMMX-構(gòu)象搜索模塊使用方法[點(diǎn)擊查看
 
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你是否因為體系過于復(fù)雜而無法確定其最穩(wěn)定構(gòu)象?

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你是否因為體系過于復(fù)雜而無法確定其最穩(wěn)定構(gòu)象?

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你是否因為有多個構(gòu)象而無法確定其在光譜中的貢獻(xiàn)?

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你是否因為......?
 

GMMX將能幫助你輕松解決以上問題

GaussView 6 可以使用新增GMMX模塊進(jìn)行構(gòu)象搜索。你可以通過以下一種或多種方法進(jìn)行構(gòu)象搜索:

  • 對于 Cartesian 搜索,每個重原子將在X, Y, Z方向上隨機(jī)移動一個距離。
  • 對于Bonds方法,每個已選擇的鍵將會隨機(jī)旋轉(zhuǎn)一個值,這會使分子構(gòu)象產(chǎn)生較大變化。
  • 對于環(huán)狀化合物,在Bonds方法中提供了Ringmaker策略。它將打開環(huán)中的一根鍵,旋轉(zhuǎn)其余鍵,然后再試圖重新閉環(huán)。如果閉環(huán)之后的鍵長及鍵角不合理,那么此構(gòu)象將不會采納,程序?qū)M(jìn)入下一個可能的搜索。

一旦GMMX 搜索完成,所有的構(gòu)象信息將會列出,你可以使用GaussView 6以單個分子組形式打開和查看。同樣,你可以查看這些構(gòu)象的能量。對于大部分研究者來說這是一個非常重要的功能。

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GaussView 6 可以使用新增GMMX模塊對所研究分子進(jìn)行構(gòu)象搜索,并且顯示各個構(gòu)象的能量。

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