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Gaussian 16安裝指南
發(fā)布時間:2017-11-21
關(guān)鍵詞:Gaussian 16 安裝指南
溫馨提示:
如果您的Linux系統(tǒng)安裝了X圖形界面(像Windows那樣),下面的操作基本上都可以在圖形界面下實現(xiàn),如創(chuàng)建用戶,創(chuàng)建目錄,復(fù)制文件,解壓縮,編輯文本文件等。gaussian的安裝非常簡單,不需要root管理員權(quán)限,只需要普通用戶權(quán)限即可??梢栽谧烂纥c擊鼠標右鍵,Open Terminal打開終端窗口,進入SHELL命令行。此處假設(shè)用于安裝的普通賬戶名為han:
步驟1. 把g16的安裝文件E64_930X.tbz拷貝到一個合適的目錄下,假設(shè)為/home/han/gaussian
(此處E64_930X.tbz即為Gaussian軟件安裝文件,可能根據(jù)版本不同名字略有差異,但文件后綴都是.tbz。)
我們假設(shè)光驅(qū)自動掛載在位置:/mnt/media/cdrom/
可以用如下命令創(chuàng)建文件夾,進入文件夾,復(fù)制文件:
mkdir -p /home/han/gaussian
cd /home/han/gaussian
cp /mnt/media/cdrom/tar/E64_930X.tbz ./
我們需要建立一個文件夾用于存放高斯計算的臨時文件,例如可以放在用戶根目錄下(即:/home/han/ 下面)
mkdir -p /home/han/tmp
步驟2. 然后使用命令tar來解壓安裝文件
tar -xjvf E64_930X.tbz
解壓之后當(dāng)前目錄下會出現(xiàn)一個名為g16的新目錄,即/home/han/gaussian/g16。在該g16文件夾下有一系列exe文件,還有bsd等目錄。
g16的安裝主目錄位置即為:/home/han/gaussian/
步驟3. 運行該文件夾下的安裝程序
./g16/bsd/install
步驟4. 設(shè)置高斯的環(huán)境變量,以方便運行程序
首先需要確認您賬戶的登錄SHELL類型,可以用如下方法進行檢測:
[root@t5500 ~]# echo $SHELL
/bin/bash
[han@t5500 ~]$ echo $SHELL
/bin/tcsh
如果顯示是bash,則使用vi編輯/home/han/.bashrc 或者 .bash_profile文件,加入以下3行文字內(nèi)容。命令為:
vi /home/han/.bashrc //此文件每打開一個終端都會自動加載一次,適合經(jīng)常需要修改的環(huán)境變量
vi /home/han/.bash_profile //此文件只在系統(tǒng)登錄時自動執(zhí)行,適合設(shè)置不經(jīng)常修改的環(huán)境變量
export g16root=/home/han/gaussian/
export GAUSS_SCRDIR=/home/han/tmp
export GAUSS_EXEDIR=$g16root/g16
source $g16root/g16/bsd/g16.profile
如果顯示是tcsh,則使用vi編輯/home/han/.cshrc文件,加入以下3行文字內(nèi)容。命令為:
vi /home/han/.cshrc
setenv g16root /home/han/gaussian/
setenv GAUSS_SCRDIR /home/han/tmp
setenv GAUSS_EXEDIR $g16root/g16
source $g16root/g16/bsd/g16.login
最后,驗證環(huán)境變量是否設(shè)置成功
依據(jù)賬戶的登錄SHELL類型,使用下面的命令之一來使剛編輯的環(huán)境變量文件生效,如果您新開了terminal終端窗口,則會自動執(zhí)行,無需手動source:
source /home/han/.cshrc
或
source /home/han/.bashrc
source /home/han/.bash_profile
然后使用which g16來查找程序位置,如果輸出結(jié)果為/home/han/gaussian/g16/g16則表示安裝成功。
[root@t5500 ]# which g16
/home/han/gaussian/g16/g16
附錄:Vi程序基本使用方法
進入vi界面之后,按“i”鍵進入輸入編輯模式,按“esc”鍵則是退出編輯模式。改完之后如果需要保存退出,可以按Shift加“:”,然后在冒號之后輸入wq,按回車即可存盤退出。