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使用freqchk命令進(jìn)行熱力學(xué)校正
(一)引言:
? 在使用Gaussian進(jìn)行計(jì)算時(shí),我們根據(jù)所要研究體系的狀態(tài)設(shè)置溫度和壓力等條件,教程二十三介紹了如何設(shè)置體系的溫度和壓力。但在某些體系中,我們想要考察該體系在不同溫度和壓力下的熱力學(xué)量,應(yīng)該怎么辦呢?我們并不需要重新設(shè)定溫度和壓力重新進(jìn)行計(jì)算(重新進(jìn)行頻率計(jì)算需要花費(fèi)大量的計(jì)算時(shí)間)。本文以教程二十三中的甲烷計(jì)算為例,將介紹如何使用freqchk命令產(chǎn)生不同溫度和壓力下的熱力學(xué)數(shù)值。
(二)計(jì)算過(guò)程:
1.計(jì)算設(shè)置:
█ 軟件版本Gaussian 16, GaussView 6。使用方法 # B3LYP/6-31G(d) opt freq
█ 先使用GaussView 6構(gòu)建甲烷模型,然后按照上述方法設(shè)置,保存輸入文件名為methane.gjf,chk文件名為methane.chk,此處省略計(jì)算過(guò)程。
2.Windows (Linux)下使用freqchk命令產(chǎn)生不同溫度和壓力下的熱力學(xué)數(shù)值
█ 首先打開(kāi)Gaussian 16的界面,然后點(diǎn)擊界面上的Utilities功能,選中freqchk命令,然后到chk文件保存目錄,打開(kāi)methane.chk文件。得到如下界面:
█ 注意,Linux 系統(tǒng)下只要在命令行模式下輸入freqchk methane.chk 即可(需要在目標(biāo)chk文件所在目錄下進(jìn)行該命令,如果不在,則輸入絕對(duì)路徑效果一樣)。以下內(nèi)容Windows和Linux都一致。
█ 本文為了能夠更清晰地展示,此處把上圖中的信息以文本形式展現(xiàn)出來(lái):
█ 設(shè)置完畢參數(shù)后,就會(huì)輸出該溫度和壓力下的熱力學(xué)校正值,如下圖:
█ 值得注意的是,此處并未給出該體系最終的熱力學(xué)數(shù)值。若要得到體系最終的熱力學(xué)數(shù)值,需要使用0K 時(shí)體系的電子能量(即教程二十三中提到的Electronic Energy或EE值)再加上這個(gè)校正值。比如用EE + Thermal Enthalpy Correction 就是該體系在500K,20.0 atm下的焓值;EE + Thermal Free Energy Correction 就是該體系在500K,20.0 atm下的吉布斯自由能值。
█ 最后,還有一個(gè)更為簡(jiǎn)便的命令組合,可以實(shí)現(xiàn)上述過(guò)程。并且把結(jié)果輸入到correct.txt文件中,如下:
freqchk methane.chk n 500 20.0 1 yn> correct.txt
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