登 錄
請使用Email和密碼登陸
注冊賬號
注冊只需要不到一分鐘,請?zhí)顚懻_的Email地址以便聯(lián)系。
軟件教程
來自我們的高級技術(shù)支持專家,精心撰寫整理的原創(chuàng)學(xué)習(xí)教程
原創(chuàng)精選
便捷搜索
快速入門和提高
Sidebar
搜索教程內(nèi)容
相關(guān)學(xué)習(xí)教程
- 使用freqchk命令進(jìn)行熱力學(xué)校正
- 教程(二十四)使用freqchk命令進(jìn)行熱力學(xué)校正
- 教程(二十三)GaussView使用技巧-如何設(shè)定溫度和壓力
- 教程(二十二)GaussView使用技巧-如何將指定區(qū)域原子進(jìn)行固定
- 教程(二十一)幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化中如何固定部分原子
- 教程(二十)GaussView使用技巧-如何保存動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)圖
- 教程(十九)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)(IRC)計(jì)算
- 教程(十八)過渡態(tài)搜索(三)
- 教程(十七)Gaussian計(jì)算服務(wù)器的配置
- 教程(十六)AMPAC專業(yè)級半經(jīng)驗(yàn)量子力學(xué)模塊安裝
教程(二十一)幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化中如何固定部分原子
(一)引言:
? 在幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化時(shí),我們有時(shí)需要固定某些原子以達(dá)到研究的某種目的。比如,研究表面化學(xué)問題時(shí),常常固定材料基底;使用ONIOM模型時(shí),也會(huì)將低層的原子坐標(biāo)進(jìn)行固定,等等。本文將介紹如何固定原子坐標(biāo)。
(二)設(shè)置過程:
1. 方法一:笛卡爾坐標(biāo)前加入“-1”標(biāo)志
█ 軟件版本Gaussian 16, GaussView 6。
█ 以甲烷分子為例,首先繪制一個(gè)甲烷分子。然后保存為輸入文件,然后使用寫字板(或者其它文本編輯器)打開輸入文件,顯示如下:
█ 如果需要固定某個(gè)原子,則在笛卡爾坐標(biāo)前加入“-1”標(biāo)志即可。比如,本例假設(shè)需要固定的原子為1號C和2號H,則輸入文件格式如下圖所示:
2. 方法二:使用Opt=ReadOpt關(guān)鍵詞指定
█ 此關(guān)鍵詞意思是讀入需要優(yōu)化的原子,默認(rèn)是全部優(yōu)化的。如果需要固定某些原子,則使用NotAtoms參數(shù)來指定。例如上例需要固定1號C和2號H,則輸入文件為:
█ 用opt=readopt來設(shè)置往往比方法一的做法方便得多。關(guān)于此關(guān)鍵詞更多的用法,可以參考Gaussian官網(wǎng)相關(guān)內(nèi)容:http://gaussian.com/opt/
您認(rèn)為本教程對您有幫助嗎?
沒有找到滿意的教程?找技術(shù)專家?guī)兔?/h2>提交技術(shù)請求
綜合用戶提交的技術(shù)請求,我們可能推出相應(yīng)的專題教程