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教程(七)分子軌道(一)
(一)引言:
? 在量子化學計算中,通常需要繪制出分子軌道用于分析分子的物理化學性質(zhì)。本系列將由簡入深,逐漸介紹分子軌道的繪制、分子軌道的成分分析以及在實際研究中的作用。
? 本文以苯分子為例先介紹分子軌道的繪制。
(二)計算過程:
1. 準備fchk文件(windows版Gaussian用chk文件即可)
█ 軟件版本Linux Gaussian 16, Windows GaussView 6,使用方法B3LYP/6-31G(d);chk文件名為benzene.chk
█ 輸入文件benzene.gjf如下
█ 優(yōu)化得到穩(wěn)定結(jié)構(gòu)后,在當前目錄下會生成benzene.chk文件,然后使用formchk功能處理得到benzene.fchk文件,如下所示:
2. Windows 版本GaussView 6 繪制分子軌道
█ 得到benzene.fchk文件后,從服務器下載到本地,然后打開,得到下圖:
█ 然后點擊GaussView 6面板上的分子軌道圖標 ,得到新的分子軌道面板:
◆ 下圖中,右邊為分子軌道列表,數(shù)值為分子軌道能量(原子單位),黃色部分為需要繪制的分子軌道(此例中分別為HOMO和LUMO)
◆ 從圖中可以看出HOMO, HOMO-1能量相同,因此是簡并軌道。同理,苯分子還有很多簡并軌道。
◆ 點擊下方Visualize 中的update按鈕即可產(chǎn)生分子軌道。
█ 得到的HOMO及LUMO軌道如下所示:
苯分子的HOMO及LUMO軌道圖形
█ 從上圖可以看出,HOMO軌道是由C原子p軌道組成的成鍵π軌道,而LUMO則是C原子p軌道組成的反鍵π軌道
█ 使用GaussView 6 可以把苯分子所有的分子軌道都繪制出來,例如教科書中常用的大π軌道:
苯分子的大π軌道(HOMO-4)
(三)知識背景:
? 分子軌道理論參考
█ 《結(jié)構(gòu)化學基礎》,周公度,第5版。
? 分子軌道理論又稱分子軌道法(Molecular Orbital Theory)或MO法,1932年由美國化學家馬利肯(R.S.Mulliken)及德國物理學家洪特(F.Hund)提出,是現(xiàn)代共價鍵理論之一。它的要點是:從分子的整體性來討論分子的結(jié)構(gòu),認為原子形成分子后,電子不再屬于個別的原子軌道,而是屬于整個分子的分子軌道,分子軌道是多中心的;分子軌道由原子軌道組合而成,形成分子軌道時遵從能量近似原則、對稱性一致(匹配)原則、最大重疊原則,即通常說的“成鍵三原則”;在分子中電子填充分子軌道的原則也服從能量最低原理、泡利不相容原理和洪特規(guī)則。
? 分子軌道理論可以用于解釋配合物的穩(wěn)定性、芳香性物質(zhì)的穩(wěn)定性以及有機化學中的狄爾斯-阿德耳反應(Diels-Alder Reaction)等。
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