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教程(十)分子軌道(二)
(一)引言:
? 在量子化學計算中,通常需要繪制出分子軌道用于分析分子的物理化學性質。本系列將由簡入深,逐漸介紹分子軌道的繪制、分子軌道的成分分析以及在實際研究中的作用。
? 前文以苯分子為例,介紹了分子軌道如何繪制。本文以N2分子為例,結合結構化學中的基本知識,來探討N2分子的軌道組成。
(二)計算過程:
1. 準備fchk文件(windows版Gaussian用chk文件即可)
█ 軟件版本Linux Gaussian 16, Windows GaussView 6,使用方法B3LYP/6-31G(d)
█ chk文件名為N2.chk,并利用formchk命令將N2.chk轉換為 N2.fchk (具體可參考分子軌道(一))
2. 分子軌道的繪制
█ 參考分子軌道(一)的操作,繪制出N2分子所有的占據(jù)軌道以及LUMO軌道(共8個),如下圖:
█ 根據(jù)結構化學中雙原子分子軌道的內容再結合GaussView 6繪制出的分子軌道形狀,可將軌道成分劃分如下(參考本文知識背景)
◆ 可以發(fā)現(xiàn),分子軌道能級計算結果和結構化學書上保持一致。從這個簡單的例子出發(fā),我們就可以更深刻、更形象地認識到原子軌道如何線性組合為分子軌道了。
◆ 從圖中可知,HOMO軌道(7)的電子云主要分布在N-N鍵軸上,因此如果和金屬形成配位作用時,主要在鍵軸方向發(fā)生配位作用,是給電子過程。LUMO軌道(8)的電子云為花瓣型,在與金屬形成配位作用時,主要在鍵軸側面發(fā)生配位作用,是得電子的過程。(見參考信息)
紅外光譜計算設置
█ 細心的用戶會發(fā)現(xiàn),此例中GaussView顯示N2分子的全部軌道數(shù)目為30,而不是結構化學中畫出的14個軌道,這是為什么呢?
◆ 原因是我們使用的基組為6-31G(d),這個基組下每個N原子由15個基函數(shù)描述,因此N2就有30個基函數(shù),即最終會組合出30個分子軌道。
(三)知識背景:
? 原子軌道線性組合為分子軌道簡介:
? 分子軌道理論參考
█ 《結構化學基礎》,周公度,第5版。
█ 吳新濤,盧嘉錫。固氮酶活性中心網(wǎng)兜模型研究的回顧和前瞻[J]. 科學通報, 1995, 40(7):577-581.
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