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- 教程(二十三)GaussView使用技巧-如何設(shè)定溫度和壓力
- 教程(二十二)GaussView使用技巧-如何將指定區(qū)域原子進(jìn)行固定
- 教程(二十一)幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化中如何固定部分原子
- 教程(二十)GaussView使用技巧-如何保存動態(tài)結(jié)構(gòu)圖
- 教程(十九)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)(IRC)計算
- 教程(十八)過渡態(tài)搜索(三)
- 教程(十七)Gaussian計算服務(wù)器的配置
- 教程(十六)AMPAC專業(yè)級半經(jīng)驗(yàn)量子力學(xué)模塊安裝
教程列表27條
【2019-10-24】教程(十五)GaussView使用技巧-如何同時顯示HOMO-LUMO軌道
(一)引言:
? GaussView中有很多功能,但我們平時在使用時用到的功能較少。本系列將結(jié)合筆者多年的使用經(jīng)驗(yàn),介紹GaussView的使用技巧。
? 在對分子軌道進(jìn)行分析時,我們常常使用GaussView將分子的HOMO,LUMO軌道繪制出來,用于分析分子軌道組成、反應(yīng)活性、電子躍遷等問題。通常兩個圖都是分開繪制的,如果兩個圖能夠在同一個結(jié)構(gòu)中同時顯示,會對討論的問題有更大幫助。
【2019-10-24】教程(十四)GaussView使用技巧-在質(zhì)心添加原子或分子
(一)引言:
? GaussView中有很多功能,但我們平時在使用時用到的功能較少。本系列將結(jié)合筆者多年的使用經(jīng)驗(yàn),介紹GaussView的使用技巧。
? 當(dāng)要在材料的中心(或某一區(qū)域的中心)添加原子(或分子)時,如何精準(zhǔn)、有效構(gòu)建所需要的模型呢?本文將以足球烯(C60))及其衍生物為例,介紹如何在其中心位置放入所需要的原子(或分子)。
(二)建模過程:
1. C6
【2019-10-24】教程(十三)GaussView使用技巧-如何更換原子顏色
(一)引言:
? 在使用GaussView制作圖片時,我們可能會覺得某個(或某幾個)原子的顏色不美觀。本文將講解如何使用GaussView將原子換成自己喜歡的顏色。
(二)設(shè)置過程:
1. 畫出甲烷分子
█ 軟件版本GaussView 6
2. 顏色設(shè)置
█ 點(diǎn)擊File下的Preference功能:
【2019-08-08】教程(十二)NBO分析中的Wiberg鍵級
(一)引言:
? 在計算化合物的結(jié)構(gòu)性質(zhì)時,我們常常需要知道原子之間的成鍵性質(zhì),其中比較重要的就是鍵級。鍵級又稱鍵序,是分子軌道法中表示相鄰的兩個原子成鍵強(qiáng)度的一種數(shù)值。在量子力學(xué)的范疇內(nèi),鍵級是難以觀測的,因此,無法用唯一的方法來給它下定義。然而,對于化學(xué)家來說,鍵級是一種非常有用的模型。Wiberg提出的鍵級定義在大部分體系中比較合理,他采用鍵指標(biāo)(bondindex)來代替鍵級(b
【2019-07-07】教程(十一)GaussView使用技巧-高亮原子的妙用
(一)引言:
? GaussView中有很多功能,但我們平時在使用時用到的功能較少。本系列將結(jié)合筆者多年的使用經(jīng)驗(yàn),介紹GaussView的使用技巧。
? 在使用GaussView建模時,當(dāng)要構(gòu)建兩個分子反應(yīng)(A+B→AB)的產(chǎn)物結(jié)構(gòu)時,通常會考察不同反應(yīng)位點(diǎn)的情況,此時可以通過高亮原子功能得到不同的產(chǎn)物結(jié)構(gòu)。本文將以叔丁烷的伯碳、叔碳自由基與苯酚反應(yīng)介紹如何使用高亮原子達(dá)到快速、精準(zhǔn)
【2019-07-07】教程(十)分子軌道(二)
(一)引言:
? 在量子化學(xué)計算中,通常需要繪制出分子軌道用于分析分子的物理化學(xué)性質(zhì)。本系列將由簡入深,逐漸介紹分子軌道的繪制、分子軌道的成分分析以及在實(shí)際研究中的作用。
? 前文以苯分子為例,介紹了分子軌道如何繪制。本文以N2分子為例,結(jié)合結(jié)構(gòu)化學(xué)中的基本知識,來探討N2分子的軌道組成。
(二)計算過程:
1. 準(zhǔn)備fchk文件(windows版Gaussian用
【2019-07-05】教程(九)GaussView使用技巧-紅外-拉曼光譜圖處理
(一)引言:
? GaussView中有很多功能,但我們平時在使用時用到的功能較少。本系列將結(jié)合筆者多年的使用經(jīng)驗(yàn),介紹GaussView的使用技巧。
? 本文以丙烯氣態(tài)紅外光譜為例,介紹如何使用GaussView保存高質(zhì)量的譜圖。
(二)計算過程:
1. 紅外光譜模擬
█ 軟件版本Gaussian 16, GaussView 6
█ 使用方法:B3L
【2019-05-10】教程(八)紅外光譜模擬
(一)引言:
? 計算化學(xué)中一個很重要的內(nèi)容就是各類譜圖的模擬。紅外光譜則是計算化學(xué)中最常見的可以模擬的光譜。本章內(nèi)容以丙烯(C3H6)分子為例,介紹如何進(jìn)行紅外光譜的預(yù)測及譜峰如何指認(rèn)。
(二)計算過程:
1. 模型建立
█ 軟件版本Gaussian 16, GaussView 6
█ 使用方法:B3LYP/6-311G(d,p)。計算設(shè)置如下圖所示:
【2019-05-09】教程(七)分子軌道(一)
(一)引言:
? 在量子化學(xué)計算中,通常需要繪制出分子軌道用于分析分子的物理化學(xué)性質(zhì)。本系列將由簡入深,逐漸介紹分子軌道的繪制、分子軌道的成分分析以及在實(shí)際研究中的作用。
? 本文以苯分子為例先介紹分子軌道的繪制。
(二)計算過程:
1. 準(zhǔn)備fchk文件(windows版Gaussian用chk文件即可)
█ 軟件版本L
【2019-04-08】教程(六)GMMX 構(gòu)象搜索模塊使用方法
(一)引言:
? GaussView 6 可以使用新增GMMX模塊進(jìn)行構(gòu)象搜索。
? 一旦GMMX 搜索完成,所有的構(gòu)象信息將會列出,你可以使用GaussView 6以單個分子組形式打開和查看。同樣,你可以查看這些構(gòu)象的能量。對于大部分研究者來說這是一個非常重要的功能。
? 本文將以丙三醇(甘油)為例,講解如何使用GMMX進(jìn)行構(gòu)象搜索,繼而使用第一性原理方法進(jìn)
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